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課程名稱 |
生物資訊學
Bioinformatics |
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開課學期 |
100-2 |
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授課對象 |
學程 能源科技學程 |
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授課教師 |
曾宇鳳 |
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課號 |
CSIE5036 |
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課程識別碼 |
922 U0370 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期三5,6,7(12:20~15:10) |
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上課地點 |
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備註 |
生物資訊與系統生物學程必修課，學程學生優先選。上課地點：醫學院電腦教室R509。合開教師：TBA與林榮信、陳倩瑜、蔡孟勳、歐陽彥正合開
限學士班三年級以上
總人數上限：55人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1002bioinfo |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用，以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力，有效解決生醫研究上資料分析，生物醫學資料庫應用分析，以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號：MD&PH5028，課程識別碼：420 U3010，1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼：922 U0370，3學分)之第一小時課程主題講解部份，並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習，請改修習生物資訊學。
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課程目標 |
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課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
另約時間 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
Introduction to Bioinformatics," Arthur M. Lesk, OXFORD, 2002
Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis," David W. Mount, 2nd Edition,
Cold Spring Harbor Lab. Press
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins,
Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette, Wuket0Kussm 3rd Edition |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
上課情況 |
10% |
Class discussion |
2. |
期末考 |
30% |
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3. |
期中考 |
60% |
2 midterm, 30% each |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
02/22 |
Introduction of bioinformatics (曾宇鳳 老師) |
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第2週 |
02/29 |
Sequence analysis 1 (陳倩瑜 老師) |
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第3週 |
03/07 |
Sequence analysis 2 (陳倩瑜 老師) |
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第4週 |
03/14 |
Phylogentics analysis (曾宇鳳 老師) |
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第5週 |
03/21 |
Genome analysis (蔡孟勳 老師) |
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第6週 |
03/28 |
Gene expression 1
(蔡孟勳 老師) |
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第7週 |
04/04 |
兒童節暨民族掃墓節 (放假日) |
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第8週 |
04/11 |
Midterm 1 |
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第9週 |
04/18 |
Gene expression 2 / Genetics and population analysis 1
(蔡孟勳 老師) |
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第10週 |
04/25 |
Genetics and population analysis 2 (蔡孟勳 老師) |
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第11週 |
05/02 |
Structural classification of proteins (林榮信 老師) |
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第12週 |
05/09 |
Data mining 1 (歐陽彥正老師) |
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第13週 |
05/16 |
Midterm 2 |
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第14週 |
05/23 |
Data mining 2 (歐陽彥正 老師) |
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第15週 |
05/30 |
Structural bioinformatics
(林榮信 老師) |
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第16週 |
06/06 |
Bioinformatics database 1
(曾宇鳳 老師) |
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第17週 |
06/13 |
Bioinformatics database and ontology
(曾宇鳳 老師) |
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第18週 |
06/20 |
Final exam |
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